Le code génétique ondulatoire

A.A.Lyubischev, dès 1925, avait suggéré, que les gènes ne forment pas une mosaïque, mais une unité harmonieuse, semblable à un chœur [47]. A sa suite, en 1928. V. Beklemishev [[21]] a développé cette idée, bien qu'avec une connotation d'aphorisme, toutefois, avec une grande clairvoyance, devançant pour des décennies, l'analogie de Crick et Nirenberg qui considéraient les protéines comme des « propositions ». Il compare l'embryogenèse, aussi bien avec la musique que la parole, dans lesquelles, tout comme dans les tissus différenciés, existent des «propriétés anatomiques» — des signes de ponctuation: hauteur, intensité sonore, des harmoniques, etc.., et des propriétés ontogénétique "embryologiques» — des signes de progression du processus: le rythme, la mélodie, etc.. Les changements s'accumulent dans l'organisme en développement , alors que les changements dans le flux de la musique sont substitués, sans laisser de trace. Mais le vrai sujet du développement dans la musique est une impression esthétique; qui grandit et se développe sous l'effet du jeu musical. C'est le processus créateur de forme, d'un organisme spirituel complexe . Après cette constatation, V. Beklemishev demande: Quel est l'analogue de ce dernier, chez les animaux et les végétaux? Ne serait-ce pas le flot des stimuli formateurs, régulé par l'individualité de l'ensemble, et qui oriente la morphogenèse des parties? Continuons l'analyse du travail fondateur de F. Crick et Nirenberg, qui postulent la notion de code génétique . pages.142 -143: «… jusqu'ici, toutes les données d'expérience sont bien conforme à l'hypothèse générale, que l'information est lue par des triplets d'information de base, à partir d'une des extrémités du gène. Cependant, nous obtiendrions les mêmes résultats, si l'information était lue par des groupes de quatre et plus des bases » ou de «...groupes, contenant des nombres de bases, multiples de trois ». Cette proposition est presque oublié ou bien elle est mal comprise, mais c'est précisément ici que l'on voit le doute, sur la triplétude du code. Et il n'est pas moins important, de réaliser qu'il y a un pré-sentiment de la compréhension future des textes de l'ADN et de l'ARN comme d'entités fractales sémantiques, apparentées aux langues naturelles , ce qui est démontré dans nos recherches [[25],[26],[29]].page 153: «… un acide aminé est codé par plusieurs codons. Un tel code est dit dégénéré. Cette dégénérescence ne parle pas d'une certaine incertitude dans la construction de la molécule de protéine. Elle indique seulement, qu'un certain acide aminé peut être dirigée à un endroit approprié dans la chaîne de la molécule de protéine en utilisant plusieurs mots code distincts » . Les auteurs voient, que la synonymie ne viole pas l'univocité du code . pages 153 -154: Mais plus loin: «...Toutefois,, il existe une réelle possibilité d'apparition d'une incertitude dans la synthèse des protéines. Cette incertitude aurait pu survenir, si l'un des mots de code correspondait à plusieurs acides aminés. Jusqu'à présent un seul cas a été marqué d'une telle incertitude. La protéine, synthétisée poly-U, se compose non seulement de la Leucine, mais aussi de la Phénylalanine, et pour chaque molécule de Leucine, il y a 20 à 30 molécules de Phénylalanine . En l'absence de phénylalanine dans la solution, poly-U utilise la Leucine en quantité, égal à la moitié de la quantité normalement utilisée de la Phénylalanine. On ne connaît pas une explication moléculaire à cette incertitude ». C'est la première constatation claire de l'imperfection logique du modèle proposé de codage, de ses contradictions par rapport aux faits. Puis, des doutes se renforcent encore, page 155: « certains mots de code sont presque certainement composé de trois bases. Cependant, 18 des 20 acides aminés peuvent être codés par des mots, contenant seulement deux bases différentes. Si le code est quand même un triplet, il est alors possible, que dans certains cas l'encodage approprié aura lieu à condition, que, seulement deux des trois bases soient lus. Il est possible, qu'une telle imperfection il arrive plus souvent dans des polymères synthétiques d'ARN, contenant une ou deux bases, que dans des intermédiaires naturels d'ARN, qui toujours se composent d'un mélange des quatre bases. Par conséquent, les résultats, obtenus au moyen d'ARN artificiels, ne montent que les capacités de codage des cellules. » Clairement il y transparaît une incertitude, sur le fait que le code ne soit fait que de triplets, Il peut être egalement fait de doublets, et quadruplets et même d'héteromultiplets. Il nous semble, que dans le développement de ces doutes, que les possibilités de codage de l'ADN des chromosomes, des noyaux cellulaires, ne se limitent pas aux emblématiques triplets de nucléotides. en tant que structures semblables à des paroles, les acides nucléiques dans le milieu de la chromatine sont capables,in vivo, de former des métalangages par la méthode de fractalisation, et c'est pourquoi le codage du continuum de protéine peut passer par l’intermédiaire de gros blocs, qui codent non seulement la séquence des acides aminés dans le peptide, mais aussi la séquence des domaines protéiques, des sous-unités et même des ensembles fonctionnels des enzymes, par exemple, de la chaîne respiratoire. Dans ce cas la fractalité peut être comprise aussi bien ainsi: c'est l'ADN, l'ARN et les protéines sont tous les textes de langues distinctes, et ce qui était une «phrase» dans l'une des langues, ou une «proposition» dans une autre, à une certaine échelle , plus grande, sera un « mot ». Si on continue de zoomer, « le mot » se transforme en « lettre ».